独立核算指的是具有完整的会计凭证、会计账簿和会计报表体系，全面地记录所发生的经济业务，并定期编制财务报表的单位所进行的会计核算。实行独立核算的单位称为独立核算单位，它拥有一定数额的资金，有独立经济的自主权，独立开设银行账户，办理各项收支结算业务;设置独立的会计机构进行全面的会计核算;单独编制预算和计算盈亏。

单独设置会计机构并配备会计人员，并有完整的会计工作组织体系。又称报帐制，是把本单位的业务经营活动有关的日常业务资料，逐日或定期报送上级单位，由上级单位进行核算。非独立核算单位的特点是：一般由上级拔给一定数额的周转金，从事业务活动，一切收入全面上缴，所有支出向上级报销，本身不单独计算盈亏，只记录和计算几个主要指标，进行简易核算。比如，一个企业有很多职能部门和下属自负盈亏的公司组成，则下属公司一般为独立核算单位，而各职能部门(如办公室)则一般为非独立核算单位。

分公司独立核算的利弊如下：

1、利：

(1)、独立核算可以更好地掌握分公司的财务状况，有利于进行分析、评估和决策，更好地实现分公司的管理和控制。

(2)、独立核算可以更好地衡量分公司的经营业绩，对分公司的业务拓展、市场营销、成本控制等方面提供有力支持，有利于提高分公司的经营效益。

(3)、独立核算可以更好地保护母公司的利益，对分公司的业务风险进行评估和控制，有利于防范和控制分公司的风险。

2、弊：

(1)、独立核算可能会增加分公司的财务成本和时间成本，需要额外投入财务和人力资源进行核算和管理。

(2)、独立核算可能会增加母公司对分公司的监管和管理难度，需要加强与分公司的沟通和协作，克服信息不对称的问题。

(3)、独立核算可能会增加分公司的管理成本和复杂度，需要建立和完善分公司的财务制度和管理制度，加强对分公司的管理和控制。